在蠕动泵输送液体的过程中，液体只流经软管，不会接触到泵体的其他地方，因此只要软管能够传输的液体，蠕动泵都能传输。
蠕动泵泵管常见的使用材质是硅胶，这种硅胶材质是改良后的硅胶材质，跟市面上普通的硅胶管材质是不一样的，因为蠕动泵对软管的要求比较高，软管需要具备高回弹性，耐磨性，抗疲劳性，以及一定的抗腐蚀性，普通的硅胶软管是不可以的。一般情况下，蠕动泵用的硅胶管可以耐受无腐蚀性、弱酸碱性液体传输，食品、饮料、化妆品、生物制品、药业等液体。准择蠕动泵标配的软管均是医用等级的铂金硫化工艺硅胶管。
进口管常见的材质有以下几种：
pharmed管，在一些特殊场合中，更换软管较为繁琐，希望软管具有较高的使用寿命，这个时候就会用到进口pharmed管，组成成分是聚丙烯及usp矿物油混合物，这种管子在所有的蠕动泵用管中使用寿命长，可以达到硅胶管的十几倍的寿命，是带压工作的情况下的理想选择。pharmed软管可以用来传输中等酸碱液体传输，组织细胞培养、发酵、合成、分离、净化及工艺检测控制中（可用于敏感性细胞培养），生产滤清和发酵，无菌灌装，bpc管路系统，食品饮料、化妆品、生物制品、药业等行业，弹性非常好尤其适合电磁阀应用。
chemical管，这种管是双层管，内壁为特氟龙材料，外层为热塑高弹体，表面平滑，不含增塑剂，可以耐强酸碱及强腐蚀性有机溶剂，可输送98%浓硫酸、丙酮、甲苯类。
viton管，组成成分是氟橡胶，可以耐强酸碱（如98%浓度的浓硫酸）、大部分强腐蚀有机溶剂。
tygon管，组成成分是热塑橡胶，pvc和增塑剂混合物，可以应用于中等酸碱液体传输，理化分析仪器用软管，可耐几乎所有的实验室中常用的无机化学品，可作为冷凝器、培养箱、气管、排水管、蠕动泵等实验用软管。